شناسایی و همسانه سازی ژن داخلی مناسب پنبه در راستای افزایش کارایی بررسی های مولکولی

ژن داخلی مناسب در بررسی کیفیت DNA ژنوم و آنالیز محصولات تراریخته از اهمیت فراوانی برخوردار است. در این پژوهش، به­منظور دستیابی به ژن داخلی مناسب در پنبه، از ژن SadI استفاده شد. ابتداDNA  ژنومی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی­شده با نرم‌افزار Vector NTI، واکنش PCR انجام گرفت. محصول واکنش PCR دو قطعه 623 و 544 جفت­بازی بود. قطعات موردنظر در پلاسمید pTZ57R/T همسانه شدند. پلاسمیدهای نوترکیب از طریق PCR کلونی با آغازگرهای اختصاصی و آغازگرهای M13 شناسایی شدند. در ادامه توالی­یابی صورت گرفت. بررسی توالی نوکلئوتیدی نشان داد که این دو قطعه مربوط به نسخه­های مختلف ژن Sad1 هستند، که در نسخه اول یک حذف 79 جفت بازی در ناحیه اینترون دوم اتفاق افتاده است. این تحقیق، اولین گزارش از توالی­یابی ژن داخلی است که با اثبات وجود دو نسخه متفاوت برای ژن Sad1، می­توان در مطالعات مختلف به­عنوان ژن داخلی مناسب از آن استفاده کرد.